Gustavo Bou (43, 78 y 81) y Diego Milito (48) convirtieron los goles para el triunfo de la Academia, Federico Santander (64) descontó para el conjunto del aborigen.
Racing lidera el grupo 8 de la Copa Libertadores con 6 puntos tras las primeras dos fechas. Guaraní se mantiene con uno y deberá repuntar para su siguiente partido, el 10 de marzo de local ante el Deportivo Táchira.