Poco después de que se hayan abierto las puertas del colegio San Francisco de Asís de Canindeyú, para iniciar las elecciones, se registraron incidentes que derivaron en disparos de armas de fuego. Cuando los policías llegaron al lugar, tras escuchar la detonación, los responsables ya habían huido; afortunadamente no se registraron heridos.
También se reportaron incidentes en el colegio Naciones Unidades de la capital, donde aun no estaban disponibles los papeles para la votación, pese a que ya se abrieron las puertas para el ingreso de los electores.
Los votantes coincidieron en denunciar que las mesas de votación se habilitaron tarde en los diferentes puntos del país, sin distinción de partidos políticos.