A través de la citada resolución, el Director de la EBY delega al Jefe del Departamento Administrativo Paraguayo la facultad de autorizar el uso del aeródromo y coordinar conjuntamente con la Asesoría de Seguridad e Informaciones de Ayolas dicho usufructo. El aeródromo Juan de Ayolas se encuentra ubicado en el departamento de Misiones, según Coordenadas Geográficas S27°22’14”-W56°51’15”, con habilitación N° 761 de la DINAC.
El Protocolo establece que la solicitud de utilización debe realizarse por escrito, dirigida a la EBY, con 48 horas de antelación al uso planificado, indicando la fecha, horario, datos de la aeronave, correo electrónico o dirección de contacto de la tripulación, y el manifiesto de carga y pasajeros, si corresponde.
El jefe del Departamento Administrativo Paraguayo será responsable de otorgar la autorización correspondiente, y coordinará con la Asesoría de Seguridad e Informaciones-Ayolas, que notificará y coordinará el uso solicitado a través de correo electrónico. El horario de utilización de la pista de aterrizaje del aeródromo para todos los casos es diurno, desde la salida hasta la puesta del sol. Actualmente, el aeródromo Juan de Ayolas no puede operar en horario nocturno ni bajo condiciones mínimas de techo o instrumental debido a la falta de equipos necesarios y “Ayudas Visuales” adecuadas.